Набор для прямого секвенирования кДНК, Direct cDNA Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-DCS109

Предлагаем к покупке Набор для прямого секвенирования кДНК, Direct cDNA Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-DCS109. На рынке медицинского оборудования компания ЛидерМед Групп уже более 10 лет! С нами сотрудничают как крупные государственные учреждения, так и частные международные клиники. Среди наших поставщиков ведущие производители медоборудования с многолетней историей, опытом и надежной репутацией. Вся продукция лицензирована и сертифицирована в соответствии с установленными требованиями.

Direct cDNA Sequencing Kit— набор для прямого секвенирования кДНК. Набор предназначен для секвенирования РНК через стадию синтеза кДНК без стадии ПЦР. С помощью набораDirect DNA Sequencing Kitможно:

• идентифицировать полноразмерные транскрипты и анализировать их количество;
• исследовать дифференциальную экспрессию генов;
• характеризовать транскрипционные изоформы, варианты с альтернативным спласингом и фьюжн-транскрипты;
• секвенировать полноразмерные кДНК без артефактов, вносимых на стадии ПЦР.

В состав набора входитPro Flow Cell Priming Kitдля загрузки библиотек в ячейку, совместимый с ячейками дляPromethION
Особенности набора:

время пробоподготовки	от 270 минут
требуемое количество ДНК	100 нг полиА + РНК
необходимость обратной транскрипции	да
необходимость ПЦР	нет
длина рида	равна длине полных транскриптов
производительность	до 2 гигабаз за 6 часов, до 8 гигабаз и более за 48 часов
число ридов	5-10 миллионов полноразмерных кДНК
мультиплексирование	до 12 образцов, с Native Barcoding Expansion Pack 1-12 или 13-24
совместимые протоколы	Direct cDNA sequencing
количество библиотек	6
совместимость с проточными ячейками	FLO-MIN106D; FLO-PRO002 (PromethION)

Набор рассчитан на работу с поли-А+ РНК, но возможно также использование РНК со специфическими 3’-концевыми последовательностями (например, вирусной РНК). Для этого необходимы олигонуклеотиды, комплементарные этим последовательностям. Пробоподготовка заключается в синтезе комплементарной цепи кДНК с помощью обратной транскрипции. Обогащение библиотеки полноразмерными копиями происходит за счёт переключения цепей при обратной транскрипции (strand-switching). Затем цепь РНК расщепляется, и достраивается вторая цепь кДНК. Сиквенсные адаптеры лигируются на двухцепочечную кДНК (в нанопоры может проходить любая из цепей кДНК).
При работе сDirect cDNA Sequencing Kitпредусмотрена возможность мультиплексирования с помощью наборовNative Barcoding Expansion 1-12 (EXP-NBD104)илиNative Barcoding Expansion 13-24 (EXP-NBD105). В одну библиотеку может быть загружено до 12 образцов кДНК.
Дополнительные расходные материалы и реактивы:

• магнитные частицыAgencourt AMPure XP(Beckman Coulter);
• набор для достройки концов ДНКNEBNext End repair/ dA-tailing Module (New England BiolabsE7546);
• набор для лигированияNEB Blunt/TA Ligase Master Mix(New England BiolabsM0367);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностьюDNA LoBind(Eppendorf0030108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (AxygenPCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher ScientificR0581);
• свежеприготовленный 70 % этанол;
• 10 мМ растворdNTP(Thermo Fisher ScientificR0191);
• обратная транскриптазаMaxima H Minus(Thermo Fisher ScientificEP0751);
• ингибитор РНКазRNAseOUT(Thermo Fisher Scientific10777019);
• смесь РНКазRNAse Cocktail Enzyme Mix(Thermo Fisher ScientificAM2286).

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например,Eppendorf5452000018);
• вортекс (например,BiosanBS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм3336);
• ротационный перемешиватель (например,ElmiRM1L);
• амплификатор (например,Thermo Fisher ScientificA37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма - от 0,5 до 10 мкл (например,Eppendorf3120000020), от 2 до 20 мкл (например,Eppendorf3120000038), от 10 до 100 мкл (например,Eppendorf3120000046), от 20 до 200 мкл (например,Eppendorf3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например,Eppendorf3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS);
• охлаждающий штатив для пробирок на 0,2 мл (например,Eppendorf3881000031).

Опционально:

• флуориметр Qubit 4.0 (ThermoQ33227);
• система для фрагментного анализа (например,Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).
  

Вы можете купить Набор для прямого секвенирования кДНК, Direct cDNA Sequencing Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-DCS109 уже сегодня, связавшись с персональным менеджером по указанному номеру телефона или через почту. Вас обязательно проконсультируют по любым выбранным товарным позициям и помогут подобрать оптимальный вариант. Также рады сообщить, что доставка осуществляется по территории всей России и ближнего зарубежья. При необходимости опционально доступна поставка и установка дополнительного оборудования. После покупки предоставляется сервисное и гарантийное обслуживания.

Array